Aplicación web php en ubuntu

[fredy07]

Como lo mencione en el primer post instale todo lo necesario LAPM en Ubuntu Server 12.04, Apache 2.2, php 5.3. A ese momento no había hecho pruebas y mi duda era de como instalarlo por decirlo así en el servidor revisando un poco de literatura y alguna información en Internet decidí copiar el directorio del proyecto en /home/usuario/ y crear un acceso directo a la carpeta donde esta el index.php en /var/www/ esto para no tener que dar permisos en el directorio /var/www/ y crear vulnerabilidades en fin.
La estructura de mi proyecto es siguiendo el patrón mvc y por consiguiente esta organizado de la siguiente forma 1° el directorio principal dentro del cual se encuentra otros dos llamados /app y /web dentro de /web se encuentra el index, librerias e imagenes, mientras que en /app se encuentra la parte logica y de interfaz