Ordenando un poco el código, debería de ser así:
Código Javascript
:
Ver originaljQuery(document).ready(function(){
var div = document.querySelector("#animacion");
window.addEventListener("scroll", function(){
if (this.scrollY > (div.offsetTop - document.documentElement.clientHeight)){
jQuery('.skillbar').each(function(){
jQuery(this).find('.skillbar-bar').animate({
width: jQuery(this).attr('data-percent')
},6000);
});
}
}, false);
});
No estoy seguro de que vaya a funcionar pues no conozco la estructura que tienes elaborada ni cómo es que debería de realizarse el efecto, pero puedes probar y si no es como lo querías, vuelves y nos lo comentas para ayudarte, pero siempre con un previo análisis tuyo.
Saludos