El instalador de MySQL tiene la opción de cambiar la carpeta destino de /data. No es conveniente hacer modificaciones manuales a menos que se domine el tema.
Por otro lado, el error 2003 es un error del "Access denied", que puede tener múltiples causas, no sólo esa.
¿Verificaste con ayuda del manual de referencia? Tiene un capitulo dedicado al tema:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...ss-denied.html