Para ejecutar una animación en el momento en el que el usuario visualice un elemento (suponiendo que al inicio no pueda porque este se encuentra más abajo), necesitas calcular la altura desplazada de la barra vertical de desplazamiento y realizar una comparación con la altura del elemento menos la del documento, para lo cual necesariamente tendrás que echar mano de JavaScript.
Aquí puedes ver un pequeño ejemplo que hice.
Saludos