Hola tom2000:
De los elementos separados por split debes hacer el substr(0, 2), y luego concatenarlos ...
Prueba esto a ver si te sirve:
<b onclick="var n = '1234,4321'; alert('\'' + n.split(',')[0].substr(0, 2) + '\'%\' or Recibo.CPostalFiscal Like \'' + n.split(',')[1].substr(0, 2) + '%\'')">Pincha aquí</b>
La función sería lo que está dentro del alert.
Saludos
