Crear relaciones internas desde la programación pero no con MySQL

[gnzsoloyo]

Entonces, ¿por qué no creas un backu de la estructura de tu base en local, con todas sus relaciones (pero sin datos), y lo subes como script al servidor?
Me parece que estás complicando demasiado la cosa...

Lo que te propongo es simple:
1) Creas la base en local, con todas sus relaciones y estructuras.
2) Exportas un script sin datos de la estructura (un backup generado desde el phpMyadmin).
3) Subes el script a la base del hosting.
4) Ejecutas el script en el servidor del host, y la base se restaura allí, con todas las estructuras necesarias.

Eso es lo que se hace habitualmente, con el agregado que todo cambio que quieras hacer primero lo haces en local, y recién una vez probado, se replica en servidor, siempre por medio de scripts de SQL.

¿Se entiende la idea?

Trabajar diseñando en servidor es una mala idea. No resulta práctico.