No es que se sobreescriban en el disco, es como en programación que sobreescribes la variable.
por ejemplo si en el primero le dices:
pero en el segundo
Toma el último valor dado (green) al color de la etiqueta 'a', pero mantiente sigue manteniendo el fondo.
La única solución que no te estropearía nada, en principio, sería añadir otro css y poner su link trás los de los otros.