primero felicitaciones por pasarte al S.O. ganador
bueno ya... je je
lo que preguntas:
pues la verdad iba a empezar a responderte pero cada cosa tiene sus partes que llevan a otras y me extenderia demaciado.
está dificil explicarte desde cero linux, lo bueno seria que leyeras unos tutoriales y luego te resolvemos las dudas que tengas.
la consola es la herramienta mas util de linux, sirve para iniciar un programa con argumentos, ver sus mensajes de error, leer manuales, etc.
los programas integrados de linux están en /usr/bin los de sistema en /usr/sbin si estas en una consola de usuario.
si estás como root los programas se inician del /bin y /sbin
los programas integrados los puedes iniciar desde cualquier directorio en la consola, por ejemplo es lo mismo escribir en consola
vi o escribir
/usr/bin/vi
el root es un usuario especial que tiene acceso a todo y permisos de cambiar todo, se utiliza para realizar los cambios necesarios para que linux funcione correctamente, sin embargo se debe tener cuidado porque al no tener limites se puede borrar cosas importantes y dañar la configuracion.
lo aconsejable es entrar siempre como usuario y utilizar permisos de root desde consola cuando sea necesario con el comando su, sobre todo si se entra a internet.