Ya consegui la solucion la dejare aqui para el que la necesite
el check que se llamara Seleccionar todos es asi:
<input type="checkbox" id="CheckTodos" onchange="cambiaGrupo(this)" value="Todos"> Seleccionar Todos
y el javaScript es el siguiente
function cambiaGrupo(chk) {
var padreDIV=chk;
while( padreDIV.nodeType==1 && padreDIV.tagName.toUpperCase()!="DIV" )
padreDIV=padreDIV.parentNode;
//ahora que padreDIV es el DIV, cogeremos todos sus checkboxes
var padreDIVinputs=padreDIV.getElementsByTagName("inpu t");
for(var i=0; i<padreDIVinputs.length; i++) {
if( padreDIVinputs[i].getAttribute("type")=="checkbox" )
padreDIVinputs[i].checked = chk.checked;
}
}
Espero que a alguien ayude