Prueba a poner esto en el botón:
Código HTML:
onclick="return confirm('¿Realmente desea eliminar?');"
Si lo quieres meter en onSubmit ponlo antes que el action;
Código HTML:
<form id="act" name="act" method="POST" onSubmit="return confirmation();" action="elimina.php">
<script type="text/javascript">
function confirmation() {
if(confirm("Realmente desea eliminar?")) {
return true;
} else {
return false;
}
}
</script>
Y el If ponle como en el código que te e puesto.