Cuando ejecutas el scandisk verifica que no estes corriendo ningun programa, por que esto hara que se te reinicie varias veces el scandisk.
Con respecto a tu otra pregunta de que por que te pide un archivo lo mas posible es que tu S.O. se ta haya dañado o esté en proceso de dañarse.
Ademas no me quedo muy en claro que S.O. tienes si en windows XP pro o Windows 2000 pro
