disco duro desalineado

[juaarias]

hola, si eso mismo he leido y coinciden tu opinion, la situacion mia es la siguiente me estan pidiendo en mi trabajo que le haga la alineacion, como seria hacer la reparticion de nuevo?porque he intentado con parted desde un live cd y la particion nueva me da el mismo error,lo que probe fue lo siguiente:
parted -a opt /dev/sda
(parted) u MiB
(parted) rm 1
(parted) mkpart primary 1 100%

nose que es lo que estoy haciendo mal, la verdad nose mucho de discos y particiones mas que lo basico y esto me ha hecho perder mucho tiempo, espero puedas ayudarme desde ya gracias!!!