Estuve leyendo en otro foro
[1][2] que no es posible quitar elementos de un FileList que es lo que tienes, además, el método
remove es solo para eliminar opciones de una lista desplegable.
Si la idea es que el usuario elimine un archivo que seleccionó por error de entre la lista de archivos seleccionados, lo mejor sería que vuelva a seleccionarlos.
Saludos