Claro que si se puede hacer un array de arrays, pero en realidad sería un array de referencias de arrays, deja te pongo un código para que veas como funciona:
Código:
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
#EJEMPLO DE ARRAY DE REFERENCIAS
#:: iniciamos un array con colores
my @colores = ('rojo', 'verde', 'cafe', 'morado');
#:: iniciamos un array con dias de la semana
my @semana = ('Lunes', 'Martes', 'Miércoles', 'Jueves');
#:: hacemos nuestro array con las referencias
my @array_de_arrays = (\@colores, \@semana);
#AHORA PARA DESPLEGAR UN ELEMENTO HACEMOS ESTO
print "$array_de_arrays[0][0]\n"; #Despliega el color rojo
print "$array_de_arrays[0][3]\n"; #Despliega el color morado
print "$array_de_arrays[1][0]\n"; #Despliega el día Lunes
print "$array_de_arrays[1][2]\n"; #Despliega el día Miércoles
exit(1); #finalizamos exitosamente
SALUDOS