Funcion javascript no se ejecuta dentro del php

[Triby]

Ya que toda la cadena está encerrada entre comillas simples, debes escapar las internas, ejemplo:

onclick = "abrirVentana(\'editar.php\')"

Además, hay otras opciones para mostrar bloques de código, sobre todo si no tienes variables, es tan simple como salir del modo php ?> enviar el HTML necesario y regresar a php <?php

Ejemplo:

Código PHP:

<script>
function abrirVentana(url) {
    window.open(url, "nuevo", "directories=no, location=no, menubar=no, scrollbars=yes, statusbar=no, tittlebar=no, width=500, height=400");
}
</script>
<?php
while($noti = mysql_fetch_assoc($noti1)) {
?>
    <table style="border-collapse: collapse; width:98%; margin:0 auto; border:0;" id="AutoNumber1">
    <tr>
        <td><span class="tituloM"><?php echo htmlspecialchars($noti['titulo']); ?></span></td>
    </tr>
    <tr>
        <td style="padding-top: 10px; padding-bottom: 5px;"><span class="mensajeNuevo"><?php echo htmlspecialchars($noti['mensaje']); ?></span></td>
    </tr>
    <tr>
        <td><i><span class="autor">Publicado por: <?php echo htmlspecialchars($noti['autor']); ?></span></i></td>
    </tr>
    <tr>
        <td style="text-align:center;">
            [<a href="#" onclick="abrirVentana('editar.php?id=<?php echo $noti['id_de_noticia']; ?>'); return false; style="text-decoration: none; color: black;">Editar</a> |
            <a href="#" onclick="abrirVentana('borrar.php?id=<?php echo $noti['id_de_noticia']; ?>'); return false; style="text-decoration: none; color: black;">Borrar</a>]
        </td>
    </tr>
    </table>
    <hr color="#000000" size="1" />;
 
<?php
}
 

Por cierto:

- En cada iteración del while estabas creando la función para abrir ventana
- Te faltaba agregar la id de la noticia que se debe editar/borrar, corrige el campo id si es necesario
- Te recomiendo estudiar un poco sobre CSS, para que no tengas que usar cosas como <center> o <div align="center">