No se puede cambiar en el php.ini sino en cualquier archivo de configuración de la aplicación/servicio
Los puertos son necesarios para la comunicación ya sea entre servicios o el usuario, solo una aplicación puede usar un puerto a la vez, por ejemplo si tu aplicación incluye una interfaz web podrás verla vía
http://tudominio_o_ip:puerto normalmente se pueden cambiar para evitar conflictos con otras aplicaciones