Hola:
Con javascript (nativo o no), solo puedes acceder a la propia página o a alguna del sistema de ventanas existentes... si la página donde quieres actuar es el destino de un enlace no se puede hacer nada... podrías programar la página destino para que al cargarse trate la url y lance alguna función según éste, o después de enlazar (manteniendo el sistema de ventanas, o sea con un target, y distinto de _self), temporizar algún método para conseguir tu objetivo... o sea, un auténtico galimatías (aunque intrínsecamente quiere decir que no es posiblem depende de lo que realmente quieras, y si te he entendido... yo diría que no).
Saludos