Bootstrap: modificar código o implementar css externo?

[Jask]

Muy buenas,

Estoy leyendo y aprendiendo sobre Bootstrap constantemente y tengo una duda que he visto en diferentes sitios.

Por un lado, mencionan que para modificar Bootstrap con los colores que deseemos, fuentes, etc. recomiendan modificar el archivo .less, compilarlo y probar, pero por otro lado, en otro sitio, recomiendan embeber un .css nuevo con las modificaciones que nosotros busquemos, sin tocar la fuente del proyecto por si en un futuro queremos actualizar a una versión más moderna de Bootstrap la cual sería más sencillo que si se toca el "core" (archivos .less)

Ustedes que recomiendan? Archivo nuevo, tocar los archivos less.. ??

Gracias