Cita:
Iniciado por Principe_Azul 
Al final de todo tu código (este que te puso el compañero Heli0s) insertá estas 3 lineas, que serían los métodos para cerrar los 3 archivos que abriste:
Código Python:
Ver originalArchivo.close()
Archivo1.close()
Archivo2.close()
Buena suerte!!
Si, lo agregue, pero es raro, porque a veces me funciona y otra veces no. Se supone que en teoria al hacer enter en el IDE de python(IDLE) se ejecuta todo el codigo.
Para no seguir calentandome la cabeza baje otro IDE llamado NINJA-IDE, que es mas practico al momento de ejecutar el codigo, de hecho tiene un boton para eso.
Ahora con el nuevo IDE, me funciona siempre!