la verdad que no manejo esa libreria, pero prueba de entrada depurar tu código, o al menos setealos a ver si están trabajando... o tal vez
Código PHP:
<?php
if(isset($_POST["Consultar"])){
$store=mssql_init("Carga_masiva_Usuarios",$link);
if($query_uno=mssql_execute($store)){?>
<SCRIPT>
window.alert("Carga Base Completa");
</SCRIPT>
<?php }else{
echo "No se pudo completar el pedido";
}
}
?>