Cita: El archivo que importo lo exporto de MySQL del servidor local de mi ordenador. El formato en el que lo exporto y que lo importo posteriormente as MySQL del servidor remoto es .sql.
La pregunta subsiste: ¿Con qué lo exportas desde MySQL? ¿MySQL Workbench? ¿Linea de comandos en consola? ¿Usas mysqldump?? ¿Lo haces por medio de SELECT INTO OUTFILE? ¿usas phpMyadmin?
¿Cómo?
Ese detalle es crítico para entender en qué paso se pierden los caracteres.