Pero si ya lo tienes, solo has de rellamar a scanf el nº de veces que te diga el primer numero.
Escribes 3 123 456 789, ejecutas scanf con un solo entero y lo guardas en el contador, luego ejecutas scanf para un solo entero el nº de veces que te dice el contador.
Por pasos, primero declaras las variables:
En contador estara el numero de valores y en numero estara cada numero leido de stdin. Ahora pides la linea de numeros:
Escribes "3 123 456 789", ahora en stdin tienes ese texto, pinchas enter y se ejecuta scanf que de stdin extrae solo la primera coincidencia con el formato, en este caso %d saca el 3 y deja en el stdin el resto ("123 456 789\n", antes de pinchar el enter el \n final aun no está).
Ahora haces el bucle:
En el primer scanf extrae 123 y deja "456 789\n", en el segundo extrae 456 y deja "789\n" y en el tercero extrae 789 y deja el \n que corresponde a la tecla enter que pinchaste antes del scanf del contador.
Suerte con eso
Saludos
vosk