Doctrine cascade persist

[masterpuppet]

Al ser patron el owner side tienes que actualizar precisamente de ese lado la relación, en codigo se traduce en algo similar a mi post anterior, simplemente en el addPatern de Alert actualiza Pattern

Código PHP:

public function addPattern(PatternInterface $pattern)
{
    ...
    $pattern->setAlert($this);//update owning side
    ...
}
 

Luego lo utilizas tal cual lo tienes tu, lo has intentado como te comente ?