Si tu programa se ejecutará en consola, debes lanzarlo desde la consola. No verás nada si sólo haces doble clic sobre el .jar.
Ejemplo, si tu .jar está ubicado en la ruta /home/carlos/proyectos/myapp.jar entonces debes abrir la consola, y ubicarte en esa ruta:
Y luego ejecutar el jar:
Si deseas ejecutarlo con otra versión de Java que la que tienes por defecto, pues realiza no que menciona
nup_, que lo explicó detalladamente.