Hola:
No debería haber problemas. Si instalas correctamente java y está en su ubicación por defecto (c:\Archivos de Programa\java\....) eclipse debería encontrarlo sin problemas
Si lo has instalado en otra ubicación, debes poner la variable de entorno JAVA_HOME para que eclipse sea capaz de encontrarlo ( Sería esto
http://chuwiki.chuidiang.org/index.p...les_en_Windows pero en vez de la variable PATH que se comenta, sería JAVA_HOME apuntando a tu directorio jdk... donde lo tengas instalado).
Se bueno.