Mil gracias redlo,
Resulta que yo instale mi moodle de esta forma:
http://www.myserver.com/aula/
Cuando instalé mi componente Docman crea una carpeta sobre la raiz del dominio
----> /joomlatools-files/docman-files
Ahi es donde aloja todos los documentos.
Solo que yo esperaba encontrarla dentro de la misma carpeta del moodle, y NO, la pone sobre la raiz del sitio.
Esto lo comento como tip para los novatos... como YO, saludos y mil gracias.