Cita:
Iniciado por AlexxMF 
Y ponerlos de esta manera que inconvenientes tiene?
midominio.com/fr, midominio.com/en, etc....
No tiene ningún inconveniente más allá de la estética. Es más, yo la recomendaría ya que diría que tu dominio principal en cierto modo ganaría en autoridad (el tamaño es un factor a tener en cuenta, junto con otros, como edad, cantidad y distribución de links, etc), aunque al ser el contenido en diferentes idiomas puede ser que no afecte nada en absoluto.
Eso sí, como han comentado ya aquí, cada página tiene que tener su
canonical, y su
hreflang, indicando la página equivalente en otros idiomas.
Saludos y suerte con el proyecto.