¿Y cómo esperas ejecutar dicho script sin incluirlo?
Es decir, ya sea evaluando el script (no recomendado) o incluyéndolo es la única forma que hay de ejecutarlo.
Tal vez estás pensado mal la solución.
Generar un script y luego ejecutarlo es lo mismo que ejecutar las mismas instrucciones sin crear ningún archivo, sería bueno que muestres que hace dicho script, de otra forma no se entiende tu objetivo.