No he entendido muy bien pero...
Si son "registros" distintos de MySQL, usa la cláusula ORDER BY
Si es una columna que recibes, puedes hacer esto en php:
Código PHP:
$array_valores = explode(',', $valores);
if( rsort($array_valores) ) $valores_ordenados = implode(',', $array_valores);
Explode es para convertir una cadena en array segun un delimitador.
rsort ordena de mayor a menor un array (o sort de menor a mayor!)
E implode crea una cadena a partir de un array con un delimitador