Gracias por responder,
Tengo que realizar desde un hiperenlace de php el cual se genera dinamicamente, y este genera un alert con un mensaje, ya se hizo, pero el genera el mensaje desde el form y no del hiperenlace como deberia ser, a continuacion anexo la linea de codigo:
echo "<a href=files/$row_Recordset2[ruta]>$row_Recordset2[name]<script language='JavaScript'alert('$dos')></script></a>";
Gracias!