Problema con urls amigables

[NederFock]

(Por favor, Pido que muevan el tema si no va acá)
Buenas gente de FDW! estoy empezando recién con js y etc, y estoy teniendo un problema.

Tengo un navbar con links que me van cargando el contenido de una capa
$('#capa').load('./pagina.php');

La cuestión es que estoy intentando hacer urls amigables, para los perfiles
ej :
dominio.com/index.php?id=1
dominio.com/1
Y en el index veo si está definida la id muestre el perfil, sino, el index.

Cuestión:

Tengo el htacces así
RewriteEngine On

RewriteRule ^([a-zA-Z0-9-+/]+)$ index.php?id=$1
RewriteRule ^([a-zA-Z0-9-+/]+)/$ index.php?id=$1

y me funciona "bien", si yo entro a dominio.com/1 me lleva al perfil, pero si le doy click a uno de los links del navbar, me lleva al index por defecto al parecer, que se carga si no hay nada definido, pero en realidad me tendría que llevar a una de las secciones u.u luego de estar en el index, si puedo ir a las secciones, pero ta, los usuarios no van a clickear dos veces xD alguna idea? :S
Gracias de antemano, gente!!