Ordenar fichero binario

[daniviso92]

Hola buenas, estoy liado con un programita en java que debe coger dos ficheros binarios solo con enteros que se mezclen esos ficheros en otro y se ordenen de menor a mayor y se eliminen los repetidos... si alguien me ayuda le estaré muy agradecido ya que llevo tiempo con esto.

Código Java:

public class ProcesaFicheros {
 
    public static File mezclarFichero(File F1, File F2) {
        File fsalida = null; // Fichero resultante
 
        try {
            if (!F1.exists() || !F2.exists())
                System.out.println("Ficheros no encontrados");
            else {
                
        
                InputStream f1= new FileInputStream(F1);
                InputStream f2= new FileInputStream(F2);
                
                fsalida = new File("res" + File.separator + "Resultado.dat");
                
                OutputStream f3= new FileOutputStream(fsalida);
                
                
                
                byte[] buffer= new byte[256];
 
                
                while (true) {
                  int n= f1.read(buffer);
                  if (n < 0)
                    break;
                  f3.write(buffer, 0, n);
                }
                
                while (true) {
                  int n= f2.read(buffer);
                  if (n < 0)
                    break;
                  f3.write(buffer, 0, n);
                }
 
                // Cierre de flujos
                f1.close();
                f2.close();
 
                f3.close();
            }
        } catch (IOException e) {
            System.out.println("Error al acceder al fichero Mezcla");
        } catch (Exception e) {
            System.out.println(e.getMessage());
        }
 
        return fsalida;
    }
 
    public static void mostrarFichero(File f) {
        try {
 
            if (!f.exists())
                System.out.println("Fichero no encontrado: "+ f.getName() );
            else {
                // Asociamos el flujo de acceso directo a los datos binarios del
                // descriptor (MODO LECTURA)
                RandomAccessFile fichero = new RandomAccessFile(f, "r");
 
                while (fichero.getFilePointer() < fichero.length()) {
                    System.out.print("Posición: " + fichero.getFilePointer());
                    System.out.print(" Valor: " + fichero.readInt() + "\n");
 
                    // Actualizo posición del puntero
                    // Uso del puntero para posicionarnos
                    fichero.seek(fichero.getFilePointer());
                }
 
 
                fichero.close();
            }
        } catch (IOException e) {
            System.out.println("Error al acceder al fichero");
        } catch (Exception e) {
            System.out.println(e.getMessage());
        }
    }
 
    public static void main(String[] args) {
        File f1 = new File("res" + File.separator + "Desordenado.dat");
        File f2 = new File("res" + File.separator + "Aleatorio.dat");
        File f3 = new File("res" + File.separator + "Resultado.dat");
        File f4 = new File("res" + File.separator + "DatosRepetidosBorrados.dat");
 
        System.out.println("->  FICHERO 1 " + f1.getAbsolutePath() + ":");
        ProcesaFicheros.mostrarFichero(f1);
 
        System.out.println("\n->  FICHERO 2 " + f2.getAbsolutePath() + ":");
        System.out.println("=========");
        ProcesaFicheros.mostrarFichero(f2);
 
        /* Fichero de mezcla: 1) File mezclarFichero (File F1, File F2) */
        File fsalida = ProcesaFicheros.mezclarFichero(f1, f2);
 
        if (fsalida != null) {
            System.out.println("\n->  FICHERO MEZCLA RESULTANTE "+ f3.getAbsolutePath() + ":");
            System.out.println("=========");
            ProcesaFicheros.mostrarFichero(f3);
        }
        
        System.out.println("\n->  FICHERO Datos repetidos borrados y ordenados " + f4.getAbsolutePath() + ":");
        System.out.println("=========");
        ProcesaFicheros.mostrarFichero(f4);
    }
}