Cita:
Iniciado por PHPeros 
¿Has cargado bien la respectiva librería?
Si, por que funciona bien con el html tipeado desde el teclado, pero no funciona desde el creado con javascript.
La función datepiker() se debe ejecutar sobre el input creado, esta es llamada por el id="fecha" ... osea que cada vez que creo un input desde javascript, es para colocarme dentro de ese input y generar la fecha..