problemas con margin al usar position fixed

[vis97c]

trabajando con jquery consegui este codigo que al hacer scroll a cierta altura de la pantalla cambia los atributos de algunos elementos y me crea una barra flotante:

Código:

<script type="text/javascript">
   $(window).scroll(function(){
            if($(window).scrollTop() > 35) {
                $('#c1-bg').css('padding-top', '0px');
                $('#c1-cont').css('position', 'fixed');
            }
            else {
                $('#c1-bg').css('padding-top', '35px');
                $('#c1-cont').css('position', 'relative');
            }
        });
  </script>

ya lo habia usado antes pero solo en elementos con un ancho fijo, pero al hacerlo en uno con margin:0 auto; y cambiar el position:relative; por un fixed este pierde su tamaño y pocision:



quisiera saber si hay alguna solucion para este problema de fixed