La verdad que no se si asi te saldra , puedes hacer algo mas sencillo primero con un select sacas los valores de la consulta donde esta la cantidad y el porcentaje, luego multiplicas ejemplo:
$cantidad = 2500;
$porcentaje = 50;
obiamente que este ejemplo es sin estar jalando los datos pero eso es lo de menos creo que se sobre entiende, luego hacemos esto:
$resultado= ($cantidad * $porcentaje) /100;
luego puedes guardar el resultado en otra tabla relacionada por id , hay tantas cosas que se pueden hacer, si no te hago la consulta es porque me da un poco de flojera xD.
