Cual es la lógica proyecto web en JAVA

[jvargasnet]

Gracias por tu respuesta,
para ser mas claro existe una pagina web
http://www.transportezavala.com/

esta es la pagina si te tomas la molestia veras que tiene un espacio en la parte inferior
para que yo implemente (el seguimiento de unidades).

por tu respuesta tengo que añadir esas paginas para que todo se vuelva un solo proyecto.
pero cual seria la estructura.
actualmente
Trafico
--WEBINF
--app
.jpp(Vistas)
--Config
.xml(Configuacion de base de datos, seguridad)
--web.xml
--PUBLIC
--bootstrap
--css
--js
--img
--SOURCE PACKAGER
--app
controller(Metodos)
dao(procedimientos)
model(Base de datos)
helper(constantes)


donde agregaria la pagina web? me puedes ayudar con tu estructura
para ver como se hace...
(View Resolver solo funciona para vistas JSP) y no se como configurar otros
tipos de vistas como html5. incluso no carga imagenes o los css...
espero dejarme entender gracias por el tiempo invertido