Entonces la navegación es en la misma página? (
algo como esto)
Si la respuesta es afirmativa, debes de usar javascript para añadir diatónicamente la clase. Lo que debes de hacer, el flujo, es mas o menos así:
Se da clic en el enlace
Se eliminan todas las clases (por ejemplo active), de los links de navegación
Se añade la clase (por ejemplo, active) al link que se le dio clic
Como ves no es nada del otro mundo
Saludos