Si las consultas son iguales. De hecho lo son en todos los clientes que puedas instalar: navicat...
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...e-scripts.html
En realidad estas abriendo un cliente que le debes decir en cada caso donde esta el servidor para conectarse .... si estas conectando con tu servidor local, localhost, si es con un servidor remoto el dominio o la IP.
Ojo los servidores remotos comerciales suelen restringir el acceso al servidor de bbdd a clientes intalados en sus propias maquinas, es decir generalmente a phpmyadmin.