supongo que estás usando LAMP. como ubuntu deriva de debian te dejo este tutorial
http://blog.desdelinux.net/instalaci...n-y-derivados/
básicamente tendrás que configurar los archivos de configuración de los tres paquetes (Apache, MYSQL y PHP) para que funcionen juntos.
si no te quieres complicar, directamente bájate el instalador LAMP de los repositorios de ubuntu, lo ejecutas y ya lo tendrías instalado.
sino, si lo que quieres es personalizar por ejemplo los directorios donde se instalan dichos paquetes, como el de MYSQL, entonces tendrás que ir paso a paso.
saludos! :D
EDITO
me equivoqué por completo porque no sabría decirte cómo relacionar apache, mysql y php de forma manual.