Lo que mencionan de CuteFTP es que si lo tienes NO TIENES que hacer todo lo anterior.
Las instrucciones son muy simples.
Sube los archivos a tu directorio en el server (el que tu quieras)
Luego, en ese mismo directorio, crea dos archivos en blanco, uno llamado config.php y otro .htaccess
Eso es todo lo que dicen las instrucciones, solo que estan escritas para hacerlas desde shell, y tu no vas a usar el shell.