En la base de datos de prestashop si la has instalado tu tendrás todos los permisos.... es cuestion de lanzarle consultas como a cualquier otra bbdd. Primero claro esta deberás conocer su estructura, pero creo que hay documentación.
Si la has contratado con el ISP habla con ellos....
Cita: ...BBDD de prestashop desde otro server?
Si es desde otro server no cambia nada des del punto de vista de la propia bbdd pero si de los permisos que tengas en el server donde este la bbdd.