cual es la medida mas pequeña que podemos poner en css, html y mas

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No puedes fraccionar un píxel. De hecho, no sé cómo será hoy, pero antes redondeaban al alza algunos navegadores y otros a la baja, con sus consiguientes problemas de compatibilidad.

Por ejemplo:

Código HTML:

<section>
  <div></div>
  <div></div>
</section>
 

Código CSS:

section {
  width: 349px;
}
 
div {
  float: left;
  width: 50%;
}
 

Pues en unos navegadores se veían las dos capas seguidas y en otros se veía uno debajo de la otra: 349*0.5=174.5 redondeando al alza 175*2=350 que es más de 349, y a la baja serían 174*348 que si que cabría en su contenedor.

Dicho esto, realmente no existe el concepto de "medida más pequeña", porque estás hablando de medidas, que sirven para medir, de por si no miden nada.

Además, el valor más pequeño para una medida siempre será cero.

Y el valor para una medida más pequeño que hay sin ser cero, será el que más se acerque a cero. Y como los números son infinitos, pues son un porrón (infinitos) de ceros como decimales.