Usar Javascript para eso es sencillamente ridículo.
Lo correcto sería utilizar enlaces o formularios para poder pasar valores entre paginas:
Código HTML:
<a href="script.php?clave=<?php echo $valor; ?>">link</a>
Porque además debes pensar en los navegadores se puede desactivar Javascript fácilmente, lo cual dejaría tu implementación inútil.
PDTA: procura separar peras de manzanas, no es justo andar combinando Javascript sin dominar su naturaleza, así que evita usarlos si puedes resolver el mismo problema usando PHP/HTML/CSS estándar.