Esos archivos no pasan por php, por lo tanto no puedes comprimirlos por esa via, solo es posible por htaccess si tu servidor lo permite.
Código Apache:
Ver originalAddOutputFilterByType DEFLATE text/xml
AddOutputFilterByType DEFLATE text/css
AddOutputFilterByType DEFLATE application/javascript
AddOutputFilterByType DEFLATE application/x-javascript
AddOutputFilterByType DEFLATE application/xml
AddOutputFilterByType DEFLATE application/xhtml+xml
AddOutputFilterByType DEFLATE application/rss+xml
prueba a poner eso en tu .htaccess y fijate si explota