Pues es bastante simple, añade un contador.
Código PHP:
Ver original$contador = 0;
echo "<table><tr>"; //aqui abres un tr
while(/*condicion*/){
$contador++;
/*echo td*/
if($contador % 3 == 0){
echo "</tr><tr>";
$contador = 0;
}
}
echo "</tr></table>"; //cierras table y el tr
Algo así
Saludos