No existen las consultas condicionales en MySQL.
Por otra parte plantear que una FK se relaciona con dos PK distintas, es un error gravísimo de fundamentos de BBDD.
Suponiendo que ese sea el caso, y sabiendo que no puede tener dos valores diferentes, es decir, o pertenece a Proyectos o pertenece a General, la solución más sencilla podría ser: