Cita:
Iniciado por pateketrueke 
Sucede que la constante PHP_EOL corresponde al fin de linea del sistema operativo del servidor, y está claro que puede ser o no compatible con el fin de linea de tu sistema operativo.
En teoría basta con usar "\n" en lugar de dicha constante.
Probé antes con "/n" y con "/r/n", por si acaso, pero nada. He probado a transferir el archivo desde el FTP con WinSCP y con FTPbox. En ambos casos ocurre igual :-/
Gracias.