borrar archivo del servidor, mediante php y mysql

[pateketrueke]

Así es, jamás debes almacenar la ruta completa del archivo (incluyendo la raíz del sitio), la idea es que pudiendo obtener dicha raíz de manera genérica siempre, entonces sólo guardes la sub-ruta del archivo (o a veces, sólo el nombre).

Ese valor si lo puedes usar para construir ambos valores: rutas físicas y URLs.

Y así tienes la certeza de sólo almacenar la parte relevante de la información, aquello que es inmutable y no cambiara por mucho.