Consulta Query no se realiza completamente

[quinqui]

Holas, agamc1993.

Haz depuración de tu código imprimiendo la sentencia INSERT por cada iteración del while que estás recorriendo. Tal vez no está iterando todas las veces que piensas, o hay un error en la formación de la consulta, etc.

Aparte, estás haciendo muchas consultas dentro de otras consultas, y no las cierras con mysql_free_result. Te recomiendo que cierres la $sqlsucursal apenas te sales de su while, y también por si acaso, asigna el resultado de mysql_query($query2) a una variable, para que no se confunda la cosa...

Saludos!