Tienes dos formas de generar cosas que excel es capaz de leer
Usar alguna libreria capaz de generar xls
Busca "excel php library" en SanGoogle no se cual aconsejar....
O generar ficheros csv directamente con php
http://us3.php.net/manual/es/function.fputcsv.php
de la consulta a un array y del array a csv.